Quần đảo Dinagat trước kia là một phần của tỉnh Surigao del Norte, tỉnh này được thành lập từ ngày 2 tháng 12 năm 2006 với việc phê chuẩn sắc lệnh Cộng hòa số 9355, theo kết quả của một cuộc trưng cầu dân ý trước đó.

Vào ngày 11 tháng 2 năm 2010, Tòa án Tối cao Philippines tuyên bố rằng việc thành lập tỉnh Quần đảo Dinagat vô hiệu và không đáp ứng được các yêu cầu về mặt bằng diện tích và nhu cầu nhân sự để thành lập chính quyền tỉnh. Quần đảo Dinagat sau đó trở lại tỉnh Surigao del Norte.[1][2][3][4][5] Tuy nhiên, ngày 30 tháng 3 năm 2011, Tòa án Tối cao đã đảo ngược lại quyết định vào năm trước, duy trì hiệu lực của sắc lệnh 9355 và Quần đảo Dinagat lại trở thành một tỉnh.[6]